中国反邪教协会于2000年11月13日成立，是由全国科技界、社会界、宗教界、法律界、新闻界等社会各界有志于反对邪教人士自愿组成，依法登记成立，是公益性、非营利性法人社会团体。

2000年11月13日，中国反邪教协会在北京中国科技会堂举中国反邪教协会成立行成立大会。会议由中国科协副主席、中国科学院院士庄逢甘主持。会上宣读了由中国科技界、社科界、医学界、法律界、宗教界和新闻界等社会各界著名人士关于联合发起成立"中国反邪教协会"的倡议书。大会讨论并通过了《中国反邪教协会章程》，选举产生了该协会第一届理事会和常务理事会及协会领导机构人员,庄逢甘为理事长，龚育之、潘家铮、傅铁山、王家福、圣辉、何祚庥、郭正谊为副理事长，王渝生为秘书长，聘请王绶琯、张光斗、胡亚美、梁守槃、梁思礼等一批老科学家为荣誉理事。